Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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FAM78BQ5VT40 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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FAM78BQ5VT40 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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FAM78BQ5VT40 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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FAM78BQ5VT40 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
FAM78BQ5VT40 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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