Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
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PTPRNQ16849 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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PTPRNQ16849 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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PTPRNQ16849 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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PTPRNQ16849 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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PTPRNQ16849 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRNQ16849 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
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