Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP10Q15642 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms