Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDCD1Q15116 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PDCD1Q15116 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDCD1Q15116 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDCD1Q15116 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDCD1Q15116 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDCD1Q15116 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDCD1Q15116 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PDCD1Q15116 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PDCD1Q15116 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PDCD1Q15116 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PDCD1Q15116 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PDCD1Q15116 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PDCD1Q15116 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PDCD1Q15116 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PDCD1Q15116 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PDCD1Q15116 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PDCD1Q15116 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PDCD1Q15116 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PDCD1Q15116 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PDCD1Q15116 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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