Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SMCO1Q147U7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SMCO1Q147U7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SMCO1Q147U7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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