Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK13Q14004 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
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