Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALCAMQ13740 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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