Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TOP3AQ13472 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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