Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX6P78412 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX6P78412 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX6P78412 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX6P78412 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX6P78412 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX6P78412 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX6P78412 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX6P78412 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX6P78412 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX6P78412 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX6P78412 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX6P78412 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX6P78412 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX6P78412 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX6P78412 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX6P78412 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX6P78412 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX6P78412 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX6P78412 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX6P78412 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX6P78412 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX6P78412 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX6P78412 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX6P78412 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX6P78412 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX6P78412 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX6P78412 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX6P78412 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX6P78412 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX6P78412 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX6P78412 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX6P78412 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX6P78412 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX6P78412 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX6P78412 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX6P78412 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX6P78412 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX6P78412 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX6P78412 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX6P78412 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX6P78412 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX6P78412 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX6P78412 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX6P78412 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX6P78412 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX6P78412 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX6P78412 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX6P78412 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX6P78412 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX6P78412 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX6P78412 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX6P78412 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX6P78412 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX6P78412 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX6P78412 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX6P78412 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX6P78412 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX6P78412 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX6P78412 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX6P78412 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX6P78412 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX6P78412 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX6P78412 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX6P78412 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX6P78412 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX6P78412 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX6P78412 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX6P78412 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX6P78412 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX6P78412 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX6P78412 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX6P78412 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX6P78412 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX6P78412 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX6P78412 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX6P78412 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX6P78412 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX6P78412 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX6P78412 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX6P78412 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX6P78412 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX6P78412 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX6P78412 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX6P78412 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX6P78412 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX6P78412 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IRX6P78412 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IRX6P78412 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IRX6P78412 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IRX6P78412 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IRX6P78412 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IRX6P78412 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IRX6P78412 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms