Protein–RNA interactions for Protein: P62834

RAP1A, Ras-related protein Rap-1A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1AP62834 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAP1AP62834 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAP1AP62834 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAP1AP62834 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAP1AP62834 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAP1AP62834 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAP1AP62834 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAP1AP62834 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
RAP1AP62834 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAP1AP62834 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms