Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UFM1P61960 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UFM1P61960 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UFM1P61960 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UFM1P61960 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UFM1P61960 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UFM1P61960 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UFM1P61960 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UFM1P61960 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UFM1P61960 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UFM1P61960 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UFM1P61960 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UFM1P61960 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UFM1P61960 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UFM1P61960 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UFM1P61960 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UFM1P61960 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UFM1P61960 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UFM1P61960 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UFM1P61960 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UFM1P61960 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UFM1P61960 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UFM1P61960 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UFM1P61960 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UFM1P61960 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UFM1P61960 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
UFM1P61960 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UFM1P61960 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
UFM1P61960 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UFM1P61960 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UFM1P61960 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UFM1P61960 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UFM1P61960 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UFM1P61960 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UFM1P61960 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UFM1P61960 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UFM1P61960 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UFM1P61960 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UFM1P61960 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
UFM1P61960 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UFM1P61960 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
UFM1P61960 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UFM1P61960 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UFM1P61960 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UFM1P61960 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UFM1P61960 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UFM1P61960 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UFM1P61960 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UFM1P61960 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UFM1P61960 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UFM1P61960 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UFM1P61960 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UFM1P61960 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UFM1P61960 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UFM1P61960 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UFM1P61960 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UFM1P61960 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UFM1P61960 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UFM1P61960 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms