Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP5P51878 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP5P51878 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP5P51878 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP5P51878 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP5P51878 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP5P51878 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP5P51878 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP5P51878 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP5P51878 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP5P51878 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP5P51878 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP5P51878 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP5P51878 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP5P51878 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP5P51878 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP5P51878 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP5P51878 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP5P51878 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP5P51878 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP5P51878 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP5P51878 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP5P51878 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP5P51878 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP5P51878 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP5P51878 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP5P51878 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP5P51878 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP5P51878 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP5P51878 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP5P51878 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP5P51878 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP5P51878 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP5P51878 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP5P51878 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP5P51878 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP5P51878 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP5P51878 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP5P51878 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP5P51878 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP5P51878 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP5P51878 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP5P51878 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP5P51878 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP5P51878 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP5P51878 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP5P51878 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP5P51878 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP5P51878 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP5P51878 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP5P51878 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP5P51878 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP5P51878 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP5P51878 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP5P51878 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP5P51878 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP5P51878 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP5P51878 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP5P51878 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP5P51878 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP5P51878 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP5P51878 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP5P51878 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP5P51878 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP5P51878 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP5P51878 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP5P51878 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP5P51878 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP5P51878 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP5P51878 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP5P51878 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP5P51878 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP5P51878 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP5P51878 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP5P51878 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP5P51878 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP5P51878 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP5P51878 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP5P51878 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP5P51878 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP5P51878 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP5P51878 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP5P51878 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP5P51878 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP5P51878 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP5P51878 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP5P51878 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP5P51878 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP5P51878 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP5P51878 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP5P51878 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP5P51878 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP5P51878 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP5P51878 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP5P51878 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP5P51878 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP5P51878 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP5P51878 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP5P51878 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP5P51878 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms