Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX1P48742 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX1P48742 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX1P48742 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX1P48742 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX1P48742 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX1P48742 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX1P48742 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX1P48742 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX1P48742 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX1P48742 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX1P48742 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX1P48742 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX1P48742 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX1P48742 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX1P48742 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX1P48742 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX1P48742 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX1P48742 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX1P48742 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX1P48742 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX1P48742 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX1P48742 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX1P48742 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX1P48742 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX1P48742 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX1P48742 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX1P48742 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX1P48742 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX1P48742 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX1P48742 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX1P48742 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX1P48742 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX1P48742 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX1P48742 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX1P48742 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX1P48742 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX1P48742 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX1P48742 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX1P48742 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX1P48742 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX1P48742 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX1P48742 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX1P48742 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX1P48742 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX1P48742 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX1P48742 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX1P48742 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX1P48742 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX1P48742 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX1P48742 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX1P48742 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX1P48742 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX1P48742 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX1P48742 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX1P48742 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX1P48742 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX1P48742 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX1P48742 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX1P48742 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX1P48742 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX1P48742 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX1P48742 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX1P48742 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX1P48742 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX1P48742 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX1P48742 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX1P48742 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX1P48742 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX1P48742 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX1P48742 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX1P48742 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX1P48742 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX1P48742 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX1P48742 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX1P48742 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX1P48742 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX1P48742 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX1P48742 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX1P48742 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX1P48742 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX1P48742 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX1P48742 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX1P48742 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX1P48742 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX1P48742 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX1P48742 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX1P48742 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX1P48742 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX1P48742 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX1P48742 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX1P48742 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX1P48742 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX1P48742 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX1P48742 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX1P48742 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX1P48742 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX1P48742 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX1P48742 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX1P48742 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms