Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CAPZBP47756 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms