Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RANGAP1P46060 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms