Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP8P40818 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
USP8P40818 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP8P40818 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP8P40818 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP8P40818 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP8P40818 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP8P40818 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP8P40818 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP8P40818 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP8P40818 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP8P40818 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP8P40818 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP8P40818 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
USP8P40818 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP8P40818 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP8P40818 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP8P40818 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP8P40818 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP8P40818 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP8P40818 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP8P40818 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP8P40818 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP8P40818 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP8P40818 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP8P40818 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP8P40818 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP8P40818 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP8P40818 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP8P40818 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP8P40818 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP8P40818 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP8P40818 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP8P40818 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP8P40818 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP8P40818 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP8P40818 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP8P40818 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP8P40818 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP8P40818 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP8P40818 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP8P40818 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
USP8P40818 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP8P40818 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP8P40818 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP8P40818 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP8P40818 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP8P40818 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP8P40818 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP8P40818 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP8P40818 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
USP8P40818 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP8P40818 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP8P40818 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP8P40818 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP8P40818 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP8P40818 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP8P40818 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP8P40818 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP8P40818 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP8P40818 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP8P40818 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP8P40818 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP8P40818 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP8P40818 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP8P40818 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP8P40818 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP8P40818 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP8P40818 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
USP8P40818 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP8P40818 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
USP8P40818 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
USP8P40818 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP8P40818 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP8P40818 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP8P40818 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP8P40818 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP8P40818 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP8P40818 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP8P40818 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP8P40818 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP8P40818 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP8P40818 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP8P40818 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP8P40818 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP8P40818 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP8P40818 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP8P40818 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP8P40818 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP8P40818 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP8P40818 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP8P40818 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP8P40818 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP8P40818 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP8P40818 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP8P40818 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP8P40818 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP8P40818 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP8P40818 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP8P40818 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms