Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms