Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms