Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LMNB1P20700 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNB1P20700 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms