Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRF1P14222 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRF1P14222 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRF1P14222 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms