Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL6A2P12110 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms