Protein–RNA interactions for Protein: P10606

COX5B, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5BP10606 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX5BP10606 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX5BP10606 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX5BP10606 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX5BP10606 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX5BP10606 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX5BP10606 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX5BP10606 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX5BP10606 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX5BP10606 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX5BP10606 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX5BP10606 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX5BP10606 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX5BP10606 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COX5BP10606 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX5BP10606 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX5BP10606 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX5BP10606 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX5BP10606 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms