Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF14O43557 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms