Protein–RNA interactions for Protein: B3KWA1

IDS, Iduronate 2-sulfatase (Hunter syndrome), isoform CRA_e, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDSB3KWA1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IDSB3KWA1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms