Protein–RNA interactions for Protein: R4GN57

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R4GN57 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
R4GN57 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
R4GN57 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
R4GN57 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
R4GN57 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
R4GN57 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
R4GN57 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
R4GN57 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
R4GN57 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
R4GN57 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
R4GN57 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
R4GN57 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
R4GN57 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
R4GN57 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
R4GN57 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
R4GN57 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
R4GN57 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
R4GN57 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
R4GN57 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
R4GN57 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
R4GN57 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
R4GN57 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
R4GN57 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
R4GN57 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
R4GN57 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
R4GN57 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
R4GN57 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
R4GN57 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
R4GN57 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
R4GN57 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
R4GN57 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
R4GN57 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
R4GN57 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
R4GN57 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
R4GN57 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
R4GN57 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R4GN57 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
R4GN57 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R4GN57 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
R4GN57 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R4GN57 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
R4GN57 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
R4GN57 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
R4GN57 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
R4GN57 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
R4GN57 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
R4GN57 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
R4GN57 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
R4GN57 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
R4GN57 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
R4GN57 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
R4GN57 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
R4GN57 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
R4GN57 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
R4GN57 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
R4GN57 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
R4GN57 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
R4GN57 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
R4GN57 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
R4GN57 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
R4GN57 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
R4GN57 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
R4GN57 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
R4GN57 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
R4GN57 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
R4GN57 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
R4GN57 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
R4GN57 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
R4GN57 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
R4GN57 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
R4GN57 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
R4GN57 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
R4GN57 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
R4GN57 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
R4GN57 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
R4GN57 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
R4GN57 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
R4GN57 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
R4GN57 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
R4GN57 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
R4GN57 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
R4GN57 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
R4GN57 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
R4GN57 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
R4GN57 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
R4GN57 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
R4GN57 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
R4GN57 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
R4GN57 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
R4GN57 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
R4GN57 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
R4GN57 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
R4GN57 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
R4GN57 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
R4GN57 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
R4GN57 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
R4GN57 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
R4GN57 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
R4GN57 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
R4GN57 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms