Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N3

CLCA3P, Calcium-activated chloride channel regulator family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA3PQ9Y6N3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCA3PQ9Y6N3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCA3PQ9Y6N3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCA3PQ9Y6N3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCA3PQ9Y6N3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLCA3PQ9Y6N3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCA3PQ9Y6N3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCA3PQ9Y6N3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCA3PQ9Y6N3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLCA3PQ9Y6N3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCA3PQ9Y6N3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCA3PQ9Y6N3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCA3PQ9Y6N3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCA3PQ9Y6N3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCA3PQ9Y6N3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCA3PQ9Y6N3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLCA3PQ9Y6N3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCA3PQ9Y6N3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCA3PQ9Y6N3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCA3PQ9Y6N3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCA3PQ9Y6N3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCA3PQ9Y6N3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCA3PQ9Y6N3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCA3PQ9Y6N3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCA3PQ9Y6N3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCA3PQ9Y6N3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCA3PQ9Y6N3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCA3PQ9Y6N3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCA3PQ9Y6N3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCA3PQ9Y6N3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCA3PQ9Y6N3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCA3PQ9Y6N3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCA3PQ9Y6N3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCA3PQ9Y6N3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCA3PQ9Y6N3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCA3PQ9Y6N3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCA3PQ9Y6N3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCA3PQ9Y6N3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCA3PQ9Y6N3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCA3PQ9Y6N3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCA3PQ9Y6N3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms