Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6K1

DNMT3A, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3AQ9Y6K1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT3AQ9Y6K1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT3AQ9Y6K1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT3AQ9Y6K1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT3AQ9Y6K1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT3AQ9Y6K1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT3AQ9Y6K1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT3AQ9Y6K1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT3AQ9Y6K1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT3AQ9Y6K1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT3AQ9Y6K1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT3AQ9Y6K1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT3AQ9Y6K1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT3AQ9Y6K1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT3AQ9Y6K1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT3AQ9Y6K1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNMT3AQ9Y6K1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNMT3AQ9Y6K1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNMT3AQ9Y6K1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DNMT3AQ9Y6K1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNMT3AQ9Y6K1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.9 ms