Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F7

CDY2A, Testis-specific chromodomain protein Y 2, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY2AQ9Y6F7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDY2AQ9Y6F7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDY2AQ9Y6F7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDY2AQ9Y6F7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CDY2AQ9Y6F7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDY2AQ9Y6F7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDY2AQ9Y6F7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDY2AQ9Y6F7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDY2AQ9Y6F7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDY2AQ9Y6F7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDY2AQ9Y6F7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDY2AQ9Y6F7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDY2AQ9Y6F7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDY2AQ9Y6F7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDY2AQ9Y6F7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDY2AQ9Y6F7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDY2AQ9Y6F7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDY2AQ9Y6F7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
CDY2AQ9Y6F7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDY2AQ9Y6F7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDY2AQ9Y6F7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDY2AQ9Y6F7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDY2AQ9Y6F7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDY2AQ9Y6F7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDY2AQ9Y6F7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDY2AQ9Y6F7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDY2AQ9Y6F7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDY2AQ9Y6F7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDY2AQ9Y6F7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDY2AQ9Y6F7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDY2AQ9Y6F7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDY2AQ9Y6F7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDY2AQ9Y6F7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDY2AQ9Y6F7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDY2AQ9Y6F7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDY2AQ9Y6F7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDY2AQ9Y6F7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CDY2AQ9Y6F7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDY2AQ9Y6F7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDY2AQ9Y6F7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDY2AQ9Y6F7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CDY2AQ9Y6F7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDY2AQ9Y6F7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CDY2AQ9Y6F7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDY2AQ9Y6F7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDY2AQ9Y6F7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDY2AQ9Y6F7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDY2AQ9Y6F7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDY2AQ9Y6F7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDY2AQ9Y6F7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDY2AQ9Y6F7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDY2AQ9Y6F7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDY2AQ9Y6F7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDY2AQ9Y6F7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDY2AQ9Y6F7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDY2AQ9Y6F7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDY2AQ9Y6F7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDY2AQ9Y6F7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDY2AQ9Y6F7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDY2AQ9Y6F7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDY2AQ9Y6F7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDY2AQ9Y6F7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDY2AQ9Y6F7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDY2AQ9Y6F7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDY2AQ9Y6F7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDY2AQ9Y6F7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDY2AQ9Y6F7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDY2AQ9Y6F7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDY2AQ9Y6F7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDY2AQ9Y6F7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CDY2AQ9Y6F7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDY2AQ9Y6F7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDY2AQ9Y6F7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDY2AQ9Y6F7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDY2AQ9Y6F7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDY2AQ9Y6F7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDY2AQ9Y6F7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDY2AQ9Y6F7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDY2AQ9Y6F7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDY2AQ9Y6F7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CDY2AQ9Y6F7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CDY2AQ9Y6F7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDY2AQ9Y6F7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDY2AQ9Y6F7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDY2AQ9Y6F7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CDY2AQ9Y6F7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDY2AQ9Y6F7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDY2AQ9Y6F7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDY2AQ9Y6F7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDY2AQ9Y6F7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDY2AQ9Y6F7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CDY2AQ9Y6F7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDY2AQ9Y6F7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDY2AQ9Y6F7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDY2AQ9Y6F7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDY2AQ9Y6F7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDY2AQ9Y6F7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDY2AQ9Y6F7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDY2AQ9Y6F7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDY2AQ9Y6F7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms