Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y9

SCN10A, Sodium channel protein type 10 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN10AQ9Y5Y9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN10AQ9Y5Y9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN10AQ9Y5Y9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN10AQ9Y5Y9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN10AQ9Y5Y9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN10AQ9Y5Y9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN10AQ9Y5Y9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN10AQ9Y5Y9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN10AQ9Y5Y9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN10AQ9Y5Y9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN10AQ9Y5Y9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN10AQ9Y5Y9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN10AQ9Y5Y9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN10AQ9Y5Y9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN10AQ9Y5Y9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN10AQ9Y5Y9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN10AQ9Y5Y9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN10AQ9Y5Y9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN10AQ9Y5Y9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN10AQ9Y5Y9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCN10AQ9Y5Y9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCN10AQ9Y5Y9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCN10AQ9Y5Y9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN10AQ9Y5Y9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN10AQ9Y5Y9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN10AQ9Y5Y9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN10AQ9Y5Y9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN10AQ9Y5Y9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN10AQ9Y5Y9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCN10AQ9Y5Y9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SCN10AQ9Y5Y9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCN10AQ9Y5Y9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCN10AQ9Y5Y9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCN10AQ9Y5Y9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN10AQ9Y5Y9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN10AQ9Y5Y9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN10AQ9Y5Y9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN10AQ9Y5Y9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN10AQ9Y5Y9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN10AQ9Y5Y9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN10AQ9Y5Y9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN10AQ9Y5Y9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN10AQ9Y5Y9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN10AQ9Y5Y9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN10AQ9Y5Y9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN10AQ9Y5Y9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN10AQ9Y5Y9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN10AQ9Y5Y9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN10AQ9Y5Y9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN10AQ9Y5Y9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCN10AQ9Y5Y9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCN10AQ9Y5Y9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCN10AQ9Y5Y9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCN10AQ9Y5Y9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCN10AQ9Y5Y9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCN10AQ9Y5Y9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCN10AQ9Y5Y9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN10AQ9Y5Y9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN10AQ9Y5Y9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN10AQ9Y5Y9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN10AQ9Y5Y9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN10AQ9Y5Y9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN10AQ9Y5Y9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN10AQ9Y5Y9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN10AQ9Y5Y9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN10AQ9Y5Y9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN10AQ9Y5Y9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCN10AQ9Y5Y9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCN10AQ9Y5Y9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCN10AQ9Y5Y9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN10AQ9Y5Y9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN10AQ9Y5Y9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN10AQ9Y5Y9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN10AQ9Y5Y9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN10AQ9Y5Y9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN10AQ9Y5Y9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN10AQ9Y5Y9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCN10AQ9Y5Y9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCN10AQ9Y5Y9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCN10AQ9Y5Y9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SCN10AQ9Y5Y9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
SCN10AQ9Y5Y9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
SCN10AQ9Y5Y9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
SCN10AQ9Y5Y9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN10AQ9Y5Y9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN10AQ9Y5Y9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN10AQ9Y5Y9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN10AQ9Y5Y9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCN10AQ9Y5Y9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN10AQ9Y5Y9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN10AQ9Y5Y9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN10AQ9Y5Y9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN10AQ9Y5Y9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN10AQ9Y5Y9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCN10AQ9Y5Y9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN10AQ9Y5Y9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN10AQ9Y5Y9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN10AQ9Y5Y9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN10AQ9Y5Y9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN10AQ9Y5Y9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms