Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNX9Q9Y5X1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNX9Q9Y5X1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNX9Q9Y5X1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX9Q9Y5X1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX9Q9Y5X1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX9Q9Y5X1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX9Q9Y5X1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX9Q9Y5X1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX9Q9Y5X1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX9Q9Y5X1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX9Q9Y5X1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX9Q9Y5X1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX9Q9Y5X1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX9Q9Y5X1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX9Q9Y5X1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX9Q9Y5X1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX9Q9Y5X1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX9Q9Y5X1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX9Q9Y5X1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX9Q9Y5X1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX9Q9Y5X1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX9Q9Y5X1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX9Q9Y5X1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX9Q9Y5X1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX9Q9Y5X1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX9Q9Y5X1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX9Q9Y5X1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX9Q9Y5X1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX9Q9Y5X1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX9Q9Y5X1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms