Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Q9Y3F1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Q9Y3F1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Q9Y3F1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q9Y3F1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q9Y3F1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q9Y3F1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q9Y3F1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q9Y3F1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q9Y3F1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q9Y3F1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q9Y3F1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Q9Y3F1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Q9Y3F1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Q9Y3F1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Q9Y3F1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Q9Y3F1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q9Y3F1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q9Y3F1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q9Y3F1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Q9Y3F1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Q9Y3F1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Q9Y3F1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Q9Y3F1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Q9Y3F1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Q9Y3F1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Q9Y3F1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Q9Y3F1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Q9Y3F1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Q9Y3F1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Q9Y3F1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q9Y3F1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q9Y3F1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q9Y3F1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q9Y3F1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Q9Y3F1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Q9Y3F1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Q9Y3F1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Q9Y3F1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Q9Y3F1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Q9Y3F1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Q9Y3F1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Q9Y3F1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Q9Y3F1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Q9Y3F1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Q9Y3F1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Q9Y3F1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Q9Y3F1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Q9Y3F1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Q9Y3F1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Q9Y3F1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Q9Y3F1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Q9Y3F1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Q9Y3F1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Q9Y3F1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Q9Y3F1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Q9Y3F1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Q9Y3F1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Q9Y3F1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Q9Y3F1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Q9Y3F1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Q9Y3F1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Q9Y3F1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Q9Y3F1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Q9Y3F1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Q9Y3F1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Q9Y3F1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Q9Y3F1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Q9Y3F1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Q9Y3F1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Q9Y3F1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Q9Y3F1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Q9Y3F1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Q9Y3F1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Q9Y3F1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Q9Y3F1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Q9Y3F1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Q9Y3F1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Q9Y3F1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Q9Y3F1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Q9Y3F1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Q9Y3F1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Q9Y3F1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Q9Y3F1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Q9Y3F1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Q9Y3F1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Q9Y3F1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Q9Y3F1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Q9Y3F1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Q9Y3F1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Q9Y3F1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Q9Y3F1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Q9Y3F1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Q9Y3F1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Q9Y3F1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Q9Y3F1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Q9Y3F1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Q9Y3F1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Q9Y3F1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Q9Y3F1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms