Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRG3Q9Y2Y8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRG3Q9Y2Y8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRG3Q9Y2Y8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRG3Q9Y2Y8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRG3Q9Y2Y8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRG3Q9Y2Y8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRG3Q9Y2Y8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRG3Q9Y2Y8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PRG3Q9Y2Y8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRG3Q9Y2Y8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRG3Q9Y2Y8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRG3Q9Y2Y8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRG3Q9Y2Y8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRG3Q9Y2Y8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRG3Q9Y2Y8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRG3Q9Y2Y8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRG3Q9Y2Y8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRG3Q9Y2Y8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRG3Q9Y2Y8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRG3Q9Y2Y8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRG3Q9Y2Y8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRG3Q9Y2Y8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRG3Q9Y2Y8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRG3Q9Y2Y8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRG3Q9Y2Y8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRG3Q9Y2Y8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRG3Q9Y2Y8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRG3Q9Y2Y8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRG3Q9Y2Y8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRG3Q9Y2Y8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRG3Q9Y2Y8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRG3Q9Y2Y8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PRG3Q9Y2Y8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PRG3Q9Y2Y8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRG3Q9Y2Y8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRG3Q9Y2Y8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRG3Q9Y2Y8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRG3Q9Y2Y8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRG3Q9Y2Y8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRG3Q9Y2Y8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRG3Q9Y2Y8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRG3Q9Y2Y8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRG3Q9Y2Y8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRG3Q9Y2Y8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRG3Q9Y2Y8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRG3Q9Y2Y8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRG3Q9Y2Y8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRG3Q9Y2Y8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRG3Q9Y2Y8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRG3Q9Y2Y8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRG3Q9Y2Y8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRG3Q9Y2Y8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRG3Q9Y2Y8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRG3Q9Y2Y8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRG3Q9Y2Y8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRG3Q9Y2Y8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRG3Q9Y2Y8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRG3Q9Y2Y8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRG3Q9Y2Y8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRG3Q9Y2Y8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRG3Q9Y2Y8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRG3Q9Y2Y8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRG3Q9Y2Y8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRG3Q9Y2Y8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRG3Q9Y2Y8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRG3Q9Y2Y8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRG3Q9Y2Y8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRG3Q9Y2Y8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRG3Q9Y2Y8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRG3Q9Y2Y8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRG3Q9Y2Y8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRG3Q9Y2Y8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRG3Q9Y2Y8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRG3Q9Y2Y8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRG3Q9Y2Y8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRG3Q9Y2Y8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRG3Q9Y2Y8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRG3Q9Y2Y8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRG3Q9Y2Y8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRG3Q9Y2Y8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRG3Q9Y2Y8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRG3Q9Y2Y8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRG3Q9Y2Y8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PRG3Q9Y2Y8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRG3Q9Y2Y8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRG3Q9Y2Y8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRG3Q9Y2Y8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PRG3Q9Y2Y8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRG3Q9Y2Y8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRG3Q9Y2Y8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRG3Q9Y2Y8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRG3Q9Y2Y8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRG3Q9Y2Y8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRG3Q9Y2Y8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRG3Q9Y2Y8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRG3Q9Y2Y8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRG3Q9Y2Y8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRG3Q9Y2Y8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PRG3Q9Y2Y8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms