Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y1

POLR3K, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3KQ9Y2Y1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR3KQ9Y2Y1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR3KQ9Y2Y1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR3KQ9Y2Y1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR3KQ9Y2Y1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR3KQ9Y2Y1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR3KQ9Y2Y1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR3KQ9Y2Y1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR3KQ9Y2Y1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3KQ9Y2Y1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR3KQ9Y2Y1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms