Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP18Q9UMW8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP18Q9UMW8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
USP18Q9UMW8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP18Q9UMW8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP18Q9UMW8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP18Q9UMW8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP18Q9UMW8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP18Q9UMW8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP18Q9UMW8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
USP18Q9UMW8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP18Q9UMW8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP18Q9UMW8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP18Q9UMW8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP18Q9UMW8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP18Q9UMW8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP18Q9UMW8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP18Q9UMW8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP18Q9UMW8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP18Q9UMW8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP18Q9UMW8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP18Q9UMW8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP18Q9UMW8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP18Q9UMW8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP18Q9UMW8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP18Q9UMW8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP18Q9UMW8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP18Q9UMW8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP18Q9UMW8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP18Q9UMW8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP18Q9UMW8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP18Q9UMW8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP18Q9UMW8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP18Q9UMW8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP18Q9UMW8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP18Q9UMW8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP18Q9UMW8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP18Q9UMW8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
USP18Q9UMW8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP18Q9UMW8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP18Q9UMW8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
USP18Q9UMW8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP18Q9UMW8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
USP18Q9UMW8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP18Q9UMW8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP18Q9UMW8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP18Q9UMW8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP18Q9UMW8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP18Q9UMW8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP18Q9UMW8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP18Q9UMW8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP18Q9UMW8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP18Q9UMW8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP18Q9UMW8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
USP18Q9UMW8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP18Q9UMW8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP18Q9UMW8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP18Q9UMW8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP18Q9UMW8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
USP18Q9UMW8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP18Q9UMW8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP18Q9UMW8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP18Q9UMW8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP18Q9UMW8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP18Q9UMW8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP18Q9UMW8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
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