Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS4

PRPF19, Pre-mRNA-processing factor 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF19Q9UMS4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF19Q9UMS4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF19Q9UMS4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF19Q9UMS4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF19Q9UMS4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF19Q9UMS4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF19Q9UMS4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF19Q9UMS4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF19Q9UMS4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF19Q9UMS4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF19Q9UMS4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF19Q9UMS4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF19Q9UMS4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF19Q9UMS4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF19Q9UMS4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF19Q9UMS4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF19Q9UMS4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF19Q9UMS4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF19Q9UMS4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF19Q9UMS4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF19Q9UMS4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF19Q9UMS4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF19Q9UMS4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF19Q9UMS4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF19Q9UMS4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF19Q9UMS4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF19Q9UMS4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF19Q9UMS4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF19Q9UMS4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF19Q9UMS4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF19Q9UMS4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF19Q9UMS4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF19Q9UMS4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF19Q9UMS4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF19Q9UMS4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRPF19Q9UMS4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF19Q9UMS4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms