Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULZ9

MMP17, Matrix metalloproteinase-17, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP17Q9ULZ9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP17Q9ULZ9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP17Q9ULZ9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP17Q9ULZ9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP17Q9ULZ9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP17Q9ULZ9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP17Q9ULZ9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP17Q9ULZ9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP17Q9ULZ9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP17Q9ULZ9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP17Q9ULZ9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP17Q9ULZ9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP17Q9ULZ9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP17Q9ULZ9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP17Q9ULZ9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP17Q9ULZ9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP17Q9ULZ9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP17Q9ULZ9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP17Q9ULZ9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP17Q9ULZ9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP17Q9ULZ9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP17Q9ULZ9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP17Q9ULZ9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP17Q9ULZ9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP17Q9ULZ9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP17Q9ULZ9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP17Q9ULZ9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP17Q9ULZ9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP17Q9ULZ9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP17Q9ULZ9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP17Q9ULZ9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP17Q9ULZ9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP17Q9ULZ9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP17Q9ULZ9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP17Q9ULZ9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP17Q9ULZ9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP17Q9ULZ9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP17Q9ULZ9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP17Q9ULZ9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP17Q9ULZ9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP17Q9ULZ9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP17Q9ULZ9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP17Q9ULZ9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP17Q9ULZ9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP17Q9ULZ9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP17Q9ULZ9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP17Q9ULZ9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP17Q9ULZ9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP17Q9ULZ9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP17Q9ULZ9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP17Q9ULZ9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP17Q9ULZ9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP17Q9ULZ9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP17Q9ULZ9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP17Q9ULZ9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP17Q9ULZ9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP17Q9ULZ9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP17Q9ULZ9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP17Q9ULZ9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP17Q9ULZ9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP17Q9ULZ9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms