Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DNMT3LQ9UJW3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DNMT3LQ9UJW3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNMT3LQ9UJW3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DNMT3LQ9UJW3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNMT3LQ9UJW3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT3LQ9UJW3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT3LQ9UJW3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT3LQ9UJW3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT3LQ9UJW3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT3LQ9UJW3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNMT3LQ9UJW3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNMT3LQ9UJW3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNMT3LQ9UJW3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNMT3LQ9UJW3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNMT3LQ9UJW3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNMT3LQ9UJW3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNMT3LQ9UJW3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNMT3LQ9UJW3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNMT3LQ9UJW3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNMT3LQ9UJW3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNMT3LQ9UJW3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNMT3LQ9UJW3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNMT3LQ9UJW3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNMT3LQ9UJW3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNMT3LQ9UJW3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNMT3LQ9UJW3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNMT3LQ9UJW3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNMT3LQ9UJW3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNMT3LQ9UJW3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DNMT3LQ9UJW3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNMT3LQ9UJW3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNMT3LQ9UJW3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNMT3LQ9UJW3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DNMT3LQ9UJW3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNMT3LQ9UJW3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DNMT3LQ9UJW3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DNMT3LQ9UJW3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNMT3LQ9UJW3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNMT3LQ9UJW3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNMT3LQ9UJW3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNMT3LQ9UJW3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNMT3LQ9UJW3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNMT3LQ9UJW3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNMT3LQ9UJW3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNMT3LQ9UJW3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNMT3LQ9UJW3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNMT3LQ9UJW3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNMT3LQ9UJW3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNMT3LQ9UJW3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNMT3LQ9UJW3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNMT3LQ9UJW3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNMT3LQ9UJW3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNMT3LQ9UJW3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNMT3LQ9UJW3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNMT3LQ9UJW3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNMT3LQ9UJW3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNMT3LQ9UJW3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNMT3LQ9UJW3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNMT3LQ9UJW3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNMT3LQ9UJW3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT3LQ9UJW3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT3LQ9UJW3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT3LQ9UJW3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT3LQ9UJW3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT3LQ9UJW3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT3LQ9UJW3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT3LQ9UJW3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT3LQ9UJW3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT3LQ9UJW3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT3LQ9UJW3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT3LQ9UJW3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT3LQ9UJW3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT3LQ9UJW3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT3LQ9UJW3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT3LQ9UJW3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNMT3LQ9UJW3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNMT3LQ9UJW3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNMT3LQ9UJW3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNMT3LQ9UJW3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNMT3LQ9UJW3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNMT3LQ9UJW3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNMT3LQ9UJW3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNMT3LQ9UJW3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNMT3LQ9UJW3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNMT3LQ9UJW3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms