Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATPIF1Q9UII2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATPIF1Q9UII2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATPIF1Q9UII2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATPIF1Q9UII2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms