Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX25Q9UHL0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX25Q9UHL0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX25Q9UHL0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX25Q9UHL0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX25Q9UHL0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX25Q9UHL0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX25Q9UHL0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX25Q9UHL0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX25Q9UHL0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX25Q9UHL0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX25Q9UHL0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX25Q9UHL0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX25Q9UHL0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX25Q9UHL0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX25Q9UHL0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX25Q9UHL0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX25Q9UHL0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX25Q9UHL0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX25Q9UHL0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX25Q9UHL0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX25Q9UHL0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX25Q9UHL0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX25Q9UHL0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX25Q9UHL0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX25Q9UHL0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX25Q9UHL0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX25Q9UHL0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX25Q9UHL0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DDX25Q9UHL0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
DDX25Q9UHL0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DDX25Q9UHL0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX25Q9UHL0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX25Q9UHL0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX25Q9UHL0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX25Q9UHL0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX25Q9UHL0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX25Q9UHL0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX25Q9UHL0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX25Q9UHL0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX25Q9UHL0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX25Q9UHL0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX25Q9UHL0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX25Q9UHL0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX25Q9UHL0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX25Q9UHL0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX25Q9UHL0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX25Q9UHL0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX25Q9UHL0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX25Q9UHL0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX25Q9UHL0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX25Q9UHL0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX25Q9UHL0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX25Q9UHL0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX25Q9UHL0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX25Q9UHL0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX25Q9UHL0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX25Q9UHL0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DDX25Q9UHL0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDX25Q9UHL0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DDX25Q9UHL0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DDX25Q9UHL0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDX25Q9UHL0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDX25Q9UHL0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDX25Q9UHL0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DDX25Q9UHL0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDX25Q9UHL0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDX25Q9UHL0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDX25Q9UHL0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDX25Q9UHL0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DDX25Q9UHL0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX25Q9UHL0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX25Q9UHL0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX25Q9UHL0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
DDX25Q9UHL0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DDX25Q9UHL0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.54■■■□□ 2
DDX25Q9UHL0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
DDX25Q9UHL0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDX25Q9UHL0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX25Q9UHL0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDX25Q9UHL0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX25Q9UHL0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX25Q9UHL0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDX25Q9UHL0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDX25Q9UHL0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDX25Q9UHL0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DDX25Q9UHL0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDX25Q9UHL0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DDX25Q9UHL0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX25Q9UHL0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX25Q9UHL0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX25Q9UHL0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX25Q9UHL0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX25Q9UHL0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX25Q9UHL0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX25Q9UHL0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX25Q9UHL0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX25Q9UHL0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX25Q9UHL0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX25Q9UHL0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms