Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA9Q9UGM1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms