Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGK8

SERGEF, Secretion-regulating guanine nucleotide exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERGEFQ9UGK8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SERGEFQ9UGK8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SERGEFQ9UGK8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SERGEFQ9UGK8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SERGEFQ9UGK8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SERGEFQ9UGK8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SERGEFQ9UGK8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SERGEFQ9UGK8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SERGEFQ9UGK8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SERGEFQ9UGK8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SERGEFQ9UGK8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SERGEFQ9UGK8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SERGEFQ9UGK8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SERGEFQ9UGK8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SERGEFQ9UGK8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SERGEFQ9UGK8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SERGEFQ9UGK8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SERGEFQ9UGK8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SERGEFQ9UGK8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SERGEFQ9UGK8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SERGEFQ9UGK8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SERGEFQ9UGK8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SERGEFQ9UGK8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SERGEFQ9UGK8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SERGEFQ9UGK8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SERGEFQ9UGK8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SERGEFQ9UGK8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SERGEFQ9UGK8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SERGEFQ9UGK8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SERGEFQ9UGK8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SERGEFQ9UGK8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SERGEFQ9UGK8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SERGEFQ9UGK8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SERGEFQ9UGK8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SERGEFQ9UGK8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SERGEFQ9UGK8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SERGEFQ9UGK8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SERGEFQ9UGK8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SERGEFQ9UGK8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SERGEFQ9UGK8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SERGEFQ9UGK8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SERGEFQ9UGK8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SERGEFQ9UGK8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SERGEFQ9UGK8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SERGEFQ9UGK8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SERGEFQ9UGK8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SERGEFQ9UGK8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SERGEFQ9UGK8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SERGEFQ9UGK8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SERGEFQ9UGK8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SERGEFQ9UGK8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SERGEFQ9UGK8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SERGEFQ9UGK8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SERGEFQ9UGK8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SERGEFQ9UGK8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERGEFQ9UGK8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERGEFQ9UGK8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERGEFQ9UGK8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERGEFQ9UGK8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms