Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY0

SLC9A2, Sodium/hydrogen exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A2Q9UBY0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC9A2Q9UBY0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC9A2Q9UBY0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC9A2Q9UBY0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC9A2Q9UBY0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC9A2Q9UBY0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC9A2Q9UBY0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC9A2Q9UBY0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC9A2Q9UBY0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC9A2Q9UBY0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC9A2Q9UBY0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC9A2Q9UBY0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC9A2Q9UBY0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC9A2Q9UBY0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC9A2Q9UBY0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC9A2Q9UBY0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC9A2Q9UBY0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC9A2Q9UBY0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC9A2Q9UBY0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC9A2Q9UBY0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC9A2Q9UBY0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC9A2Q9UBY0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC9A2Q9UBY0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC9A2Q9UBY0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC9A2Q9UBY0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC9A2Q9UBY0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC9A2Q9UBY0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC9A2Q9UBY0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC9A2Q9UBY0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC9A2Q9UBY0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC9A2Q9UBY0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC9A2Q9UBY0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC9A2Q9UBY0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC9A2Q9UBY0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC9A2Q9UBY0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC9A2Q9UBY0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLC9A2Q9UBY0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC9A2Q9UBY0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC9A2Q9UBY0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC9A2Q9UBY0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC9A2Q9UBY0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC9A2Q9UBY0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC9A2Q9UBY0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC9A2Q9UBY0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC9A2Q9UBY0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC9A2Q9UBY0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC9A2Q9UBY0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC9A2Q9UBY0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC9A2Q9UBY0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC9A2Q9UBY0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC9A2Q9UBY0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC9A2Q9UBY0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC9A2Q9UBY0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC9A2Q9UBY0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC9A2Q9UBY0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC9A2Q9UBY0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC9A2Q9UBY0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC9A2Q9UBY0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC9A2Q9UBY0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC9A2Q9UBY0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC9A2Q9UBY0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC9A2Q9UBY0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC9A2Q9UBY0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC9A2Q9UBY0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC9A2Q9UBY0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC9A2Q9UBY0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC9A2Q9UBY0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC9A2Q9UBY0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC9A2Q9UBY0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC9A2Q9UBY0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC9A2Q9UBY0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC9A2Q9UBY0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC9A2Q9UBY0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC9A2Q9UBY0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC9A2Q9UBY0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC9A2Q9UBY0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC9A2Q9UBY0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC9A2Q9UBY0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC9A2Q9UBY0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC9A2Q9UBY0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC9A2Q9UBY0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC9A2Q9UBY0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC9A2Q9UBY0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC9A2Q9UBY0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC9A2Q9UBY0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC9A2Q9UBY0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC9A2Q9UBY0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC9A2Q9UBY0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC9A2Q9UBY0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC9A2Q9UBY0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC9A2Q9UBY0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC9A2Q9UBY0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SLC9A2Q9UBY0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC9A2Q9UBY0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC9A2Q9UBY0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC9A2Q9UBY0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC9A2Q9UBY0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC9A2Q9UBY0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC9A2Q9UBY0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC9A2Q9UBY0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms