Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPASTQ9UBP0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPASTQ9UBP0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPASTQ9UBP0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPASTQ9UBP0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPASTQ9UBP0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPASTQ9UBP0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPASTQ9UBP0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPASTQ9UBP0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPASTQ9UBP0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPASTQ9UBP0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPASTQ9UBP0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPASTQ9UBP0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPASTQ9UBP0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SPASTQ9UBP0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPASTQ9UBP0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPASTQ9UBP0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPASTQ9UBP0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPASTQ9UBP0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPASTQ9UBP0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPASTQ9UBP0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPASTQ9UBP0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPASTQ9UBP0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPASTQ9UBP0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SPASTQ9UBP0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPASTQ9UBP0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPASTQ9UBP0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPASTQ9UBP0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPASTQ9UBP0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPASTQ9UBP0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SPASTQ9UBP0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SPASTQ9UBP0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPASTQ9UBP0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPASTQ9UBP0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPASTQ9UBP0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SPASTQ9UBP0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPASTQ9UBP0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPASTQ9UBP0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPASTQ9UBP0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPASTQ9UBP0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPASTQ9UBP0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPASTQ9UBP0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPASTQ9UBP0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPASTQ9UBP0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPASTQ9UBP0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPASTQ9UBP0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPASTQ9UBP0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SPASTQ9UBP0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPASTQ9UBP0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPASTQ9UBP0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SPASTQ9UBP0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPASTQ9UBP0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPASTQ9UBP0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPASTQ9UBP0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPASTQ9UBP0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPASTQ9UBP0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPASTQ9UBP0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPASTQ9UBP0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPASTQ9UBP0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPASTQ9UBP0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPASTQ9UBP0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPASTQ9UBP0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPASTQ9UBP0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPASTQ9UBP0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPASTQ9UBP0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPASTQ9UBP0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPASTQ9UBP0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPASTQ9UBP0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPASTQ9UBP0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPASTQ9UBP0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPASTQ9UBP0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPASTQ9UBP0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPASTQ9UBP0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPASTQ9UBP0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SPASTQ9UBP0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPASTQ9UBP0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPASTQ9UBP0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPASTQ9UBP0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPASTQ9UBP0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPASTQ9UBP0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPASTQ9UBP0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPASTQ9UBP0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPASTQ9UBP0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPASTQ9UBP0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPASTQ9UBP0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPASTQ9UBP0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPASTQ9UBP0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPASTQ9UBP0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPASTQ9UBP0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPASTQ9UBP0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPASTQ9UBP0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPASTQ9UBP0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPASTQ9UBP0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPASTQ9UBP0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPASTQ9UBP0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SPASTQ9UBP0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPASTQ9UBP0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SPASTQ9UBP0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPASTQ9UBP0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPASTQ9UBP0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms