Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL42Q9P2K6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL42Q9P2K6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL42Q9P2K6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL42Q9P2K6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL42Q9P2K6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL42Q9P2K6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL42Q9P2K6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL42Q9P2K6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL42Q9P2K6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL42Q9P2K6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL42Q9P2K6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL42Q9P2K6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL42Q9P2K6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL42Q9P2K6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL42Q9P2K6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL42Q9P2K6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL42Q9P2K6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL42Q9P2K6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL42Q9P2K6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL42Q9P2K6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL42Q9P2K6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL42Q9P2K6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL42Q9P2K6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL42Q9P2K6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL42Q9P2K6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL42Q9P2K6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL42Q9P2K6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL42Q9P2K6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL42Q9P2K6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL42Q9P2K6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL42Q9P2K6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHL42Q9P2K6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL42Q9P2K6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KLHL42Q9P2K6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL42Q9P2K6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL42Q9P2K6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL42Q9P2K6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL42Q9P2K6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL42Q9P2K6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL42Q9P2K6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL42Q9P2K6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL42Q9P2K6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL42Q9P2K6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL42Q9P2K6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL42Q9P2K6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL42Q9P2K6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL42Q9P2K6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL42Q9P2K6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL42Q9P2K6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL42Q9P2K6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL42Q9P2K6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL42Q9P2K6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL42Q9P2K6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL42Q9P2K6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL42Q9P2K6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL42Q9P2K6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL42Q9P2K6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL42Q9P2K6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms