Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0T7

TMEM9, Transmembrane protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM9Q9P0T7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM9Q9P0T7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM9Q9P0T7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM9Q9P0T7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM9Q9P0T7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM9Q9P0T7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM9Q9P0T7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM9Q9P0T7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM9Q9P0T7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM9Q9P0T7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM9Q9P0T7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM9Q9P0T7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM9Q9P0T7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM9Q9P0T7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM9Q9P0T7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM9Q9P0T7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM9Q9P0T7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM9Q9P0T7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM9Q9P0T7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM9Q9P0T7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM9Q9P0T7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM9Q9P0T7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM9Q9P0T7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM9Q9P0T7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM9Q9P0T7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM9Q9P0T7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM9Q9P0T7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM9Q9P0T7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM9Q9P0T7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM9Q9P0T7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM9Q9P0T7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM9Q9P0T7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM9Q9P0T7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM9Q9P0T7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM9Q9P0T7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM9Q9P0T7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM9Q9P0T7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM9Q9P0T7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM9Q9P0T7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM9Q9P0T7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM9Q9P0T7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM9Q9P0T7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM9Q9P0T7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM9Q9P0T7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM9Q9P0T7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM9Q9P0T7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM9Q9P0T7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM9Q9P0T7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM9Q9P0T7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM9Q9P0T7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM9Q9P0T7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM9Q9P0T7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM9Q9P0T7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM9Q9P0T7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM9Q9P0T7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM9Q9P0T7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM9Q9P0T7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM9Q9P0T7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM9Q9P0T7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM9Q9P0T7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM9Q9P0T7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM9Q9P0T7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM9Q9P0T7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM9Q9P0T7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM9Q9P0T7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM9Q9P0T7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM9Q9P0T7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM9Q9P0T7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM9Q9P0T7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM9Q9P0T7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM9Q9P0T7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM9Q9P0T7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM9Q9P0T7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM9Q9P0T7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM9Q9P0T7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM9Q9P0T7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM9Q9P0T7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM9Q9P0T7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM9Q9P0T7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM9Q9P0T7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms