Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM6

PKD2L2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L2Q9NZM6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKD2L2Q9NZM6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKD2L2Q9NZM6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms