Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ94

NLGN3, Neuroligin-3, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN3Q9NZ94 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLGN3Q9NZ94 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLGN3Q9NZ94 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLGN3Q9NZ94 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLGN3Q9NZ94 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLGN3Q9NZ94 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLGN3Q9NZ94 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NLGN3Q9NZ94 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLGN3Q9NZ94 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLGN3Q9NZ94 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NLGN3Q9NZ94 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLGN3Q9NZ94 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLGN3Q9NZ94 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLGN3Q9NZ94 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLGN3Q9NZ94 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLGN3Q9NZ94 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLGN3Q9NZ94 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLGN3Q9NZ94 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLGN3Q9NZ94 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLGN3Q9NZ94 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLGN3Q9NZ94 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLGN3Q9NZ94 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLGN3Q9NZ94 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NLGN3Q9NZ94 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLGN3Q9NZ94 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLGN3Q9NZ94 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NLGN3Q9NZ94 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NLGN3Q9NZ94 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLGN3Q9NZ94 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NLGN3Q9NZ94 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLGN3Q9NZ94 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLGN3Q9NZ94 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NLGN3Q9NZ94 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLGN3Q9NZ94 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLGN3Q9NZ94 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLGN3Q9NZ94 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLGN3Q9NZ94 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLGN3Q9NZ94 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLGN3Q9NZ94 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NLGN3Q9NZ94 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLGN3Q9NZ94 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLGN3Q9NZ94 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLGN3Q9NZ94 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLGN3Q9NZ94 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLGN3Q9NZ94 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLGN3Q9NZ94 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLGN3Q9NZ94 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLGN3Q9NZ94 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NLGN3Q9NZ94 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NLGN3Q9NZ94 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NLGN3Q9NZ94 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NLGN3Q9NZ94 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NLGN3Q9NZ94 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NLGN3Q9NZ94 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NLGN3Q9NZ94 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NLGN3Q9NZ94 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLGN3Q9NZ94 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.6 ms