Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ1

COA4, Cytochrome c oxidase assembly factor 4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA4Q9NYJ1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COA4Q9NYJ1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COA4Q9NYJ1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COA4Q9NYJ1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COA4Q9NYJ1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COA4Q9NYJ1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COA4Q9NYJ1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COA4Q9NYJ1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COA4Q9NYJ1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
COA4Q9NYJ1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COA4Q9NYJ1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
COA4Q9NYJ1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COA4Q9NYJ1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COA4Q9NYJ1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COA4Q9NYJ1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COA4Q9NYJ1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COA4Q9NYJ1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COA4Q9NYJ1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COA4Q9NYJ1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms