Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZDHHC3Q9NYG2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZDHHC3Q9NYG2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZDHHC3Q9NYG2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZDHHC3Q9NYG2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZDHHC3Q9NYG2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZDHHC3Q9NYG2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZDHHC3Q9NYG2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZDHHC3Q9NYG2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZDHHC3Q9NYG2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZDHHC3Q9NYG2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZDHHC3Q9NYG2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZDHHC3Q9NYG2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZDHHC3Q9NYG2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZDHHC3Q9NYG2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZDHHC3Q9NYG2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZDHHC3Q9NYG2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZDHHC3Q9NYG2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZDHHC3Q9NYG2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZDHHC3Q9NYG2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZDHHC3Q9NYG2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZDHHC3Q9NYG2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZDHHC3Q9NYG2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZDHHC3Q9NYG2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZDHHC3Q9NYG2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZDHHC3Q9NYG2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZDHHC3Q9NYG2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZDHHC3Q9NYG2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZDHHC3Q9NYG2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZDHHC3Q9NYG2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZDHHC3Q9NYG2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZDHHC3Q9NYG2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZDHHC3Q9NYG2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZDHHC3Q9NYG2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZDHHC3Q9NYG2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZDHHC3Q9NYG2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZDHHC3Q9NYG2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZDHHC3Q9NYG2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZDHHC3Q9NYG2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZDHHC3Q9NYG2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZDHHC3Q9NYG2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZDHHC3Q9NYG2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZDHHC3Q9NYG2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZDHHC3Q9NYG2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZDHHC3Q9NYG2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZDHHC3Q9NYG2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZDHHC3Q9NYG2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZDHHC3Q9NYG2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZDHHC3Q9NYG2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZDHHC3Q9NYG2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZDHHC3Q9NYG2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZDHHC3Q9NYG2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZDHHC3Q9NYG2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZDHHC3Q9NYG2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZDHHC3Q9NYG2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZDHHC3Q9NYG2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZDHHC3Q9NYG2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZDHHC3Q9NYG2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZDHHC3Q9NYG2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZDHHC3Q9NYG2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC3Q9NYG2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC3Q9NYG2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC3Q9NYG2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC3Q9NYG2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC3Q9NYG2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC3Q9NYG2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC3Q9NYG2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms