Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLDND1Q9NY35 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDND1Q9NY35 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDND1Q9NY35 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDND1Q9NY35 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDND1Q9NY35 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDND1Q9NY35 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDND1Q9NY35 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDND1Q9NY35 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDND1Q9NY35 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDND1Q9NY35 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDND1Q9NY35 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDND1Q9NY35 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDND1Q9NY35 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDND1Q9NY35 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDND1Q9NY35 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDND1Q9NY35 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDND1Q9NY35 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDND1Q9NY35 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDND1Q9NY35 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDND1Q9NY35 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDND1Q9NY35 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDND1Q9NY35 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDND1Q9NY35 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDND1Q9NY35 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDND1Q9NY35 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDND1Q9NY35 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDND1Q9NY35 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDND1Q9NY35 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLDND1Q9NY35 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLDND1Q9NY35 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLDND1Q9NY35 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLDND1Q9NY35 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLDND1Q9NY35 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CLDND1Q9NY35 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLDND1Q9NY35 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLDND1Q9NY35 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLDND1Q9NY35 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CLDND1Q9NY35 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLDND1Q9NY35 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CLDND1Q9NY35 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLDND1Q9NY35 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLDND1Q9NY35 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLDND1Q9NY35 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDND1Q9NY35 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDND1Q9NY35 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDND1Q9NY35 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDND1Q9NY35 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDND1Q9NY35 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDND1Q9NY35 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDND1Q9NY35 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDND1Q9NY35 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDND1Q9NY35 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDND1Q9NY35 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDND1Q9NY35 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDND1Q9NY35 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDND1Q9NY35 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDND1Q9NY35 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDND1Q9NY35 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CLDND1Q9NY35 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDND1Q9NY35 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms